Email: serg900@yandex.ru
Дата рождения: 11.02.1981 г.
Образование
2000г. – 2007г. Санкт-Петербургский государственный университет, биолого-почвенный факультет. Получен диплом о присуждении степени магистра биологии.
2009 – 2013г. – аспирантура Физиологического института им. И. В. Павлова РАН. Присвоена степень кандидата биологических наук.
Опыт работы
2002г. – 2008г. Физиологический институт им. И. В. Павлова РАН. Лаборант VIII разряда.
Основные обязанности: проведение научно-исследовательской работы, направленной на изучение физиологии мозга; освоение и применение электрофизиологической методики исследования на животных (создание установки для регистрации ЭКГ, выполнение операций на крысах, регистрация и анализ ЭКГ при условнорефлекторном обучении).
2008г. – 2009. ООО «Фрактал Био». Младший научный сотрудник.
Основные обязанности: освоение и оптимизация методов выделения нуклеиновых кислот, разработка систем биосинтеза рекомбинантных белков в культурах клеток E. coli и S. сerevisiae, очистка белков методом аффинной хроматографии, участие в создании тест-систем бактериальных инфекций с применением real-time RT-PCR, NASBA, написание отчетной документации по научно-исследовательским проектам (см. список), выполнение рутинных процедур молекулярной биологии (ПЦР, электрофорез, рестрикция, трансформация, иммуноблотинг)
2009г. – по настоящее время. Физиологический институт им. И. В. Павлова РАН. Научный сотрудник.
Основные обязанности: работа с линиями мух Drosophila melanogaster (ведение линий коллекции, выполнение скрещиваний, постановка экспериментов по изучению двигательной активности, звукопродукции у Р-инсерционных мутантов), молекулярно-генетические и физиологические исследования Р-инсерционных мутантов с использованием методов обратной транскрипции, количественной ПЦР в режиме реального времени, секвенирования, РНК-интерференции, иммуногистохимии, нозерн-блоттинга.
Доп. обязанности: создание и обновление контента на сайте лаборатории, техническое обслуживание оборудования лаборатории
2014г. – Арктический и антарктический научно-исследовательский институт.
Старший научный сотрудник. Биолог в составе экспедиции «Кара-зима-2014».
Основные обязанности: обнаружение, наблюдение и описание животных объектов и следов их жизнедеятельности на пути следования атомохода «Ямал» в акваториях Карского моря и моря Лаптевых, анализ полученных данных, написание отчетной документации.
2017г. – ООО «Агентство прикладной экологии». Супервайзер.
Основные обязанности: осуществление Программы производственного экологического контроля и мониторинга для оценки воздействия комплексных геофизических работ, включая сейсморазведочные работы 2Д, на лицензионном участке «Дерюгинский» в 2017 г. на морских млекопитающих, орнитофауну и ихтиофауну, принятие мер по снижению воздействия (шельфовая зона ПАО «НК Роснефть» в районе северного Сахалина, судно «Южморгеология»).
2018г. – по настоящее время. Научный сотрудник.
СПбГУ, постдокторантура. Разработка методов диагностики амилоидозов (окрашивание образцов Конго красным, метод циклической амплификации белков, анализ амилоидных свойств белков на дрожжевой модели и биохимическими методами, масс-спектрометрический анализ детергент-устойчивых белков у больных преэклампсией).
Квалификация
2009 г. – участник научно-практического семинара по микроскопии “Академия Carl Zeiss: Наука в формате 3D”, организованного на базе ЦКП института физиологии им. И.П.Павлова РАН, Санкт-Петербург.
2010 г. – получен сертификат о прохождении обучения работе на генетическом анализаторе «Applied Biosystems 3130 Genetic Analyzer».
Награды
2011 г. – дипломант I степени по итогам всероссийского конкурса научно-исследовательских работ студентов и аспирантов в области биологических наук, проведенного ФГБОУ ВПО Ульяновский государственный университет
Федотов С.А., Брагина Ю.В., Беседина Н.Г., Даниленкова Л.В., Камышева Е.А., Камышев Н.Г. Генетические детерминанты генерации моторного паттерна ритмических движений Drosophila melanogaster. Материалы всероссийского конкурса научно-исследовательских работ студентов и аспирантов в области биологических наук. Сборник материалов всероссийского конкурса научно-исследовательских работ: в 2 ч. / Под ред. Б.П. Чуракова. Ч. 2. – Ульяновск: УлГУ, 2012. С. 135.
2014 г. – дипломант III степени за лучший устный доклад на VI съезде ВОГиС
Федотов С.А., Брагина Ю.В., Молотова Н.Г., Даниленкова Л.В., Камышева Е.А., Панова А.А., Камышев Н.Г. Особенности применения нейроспецифичного нокдауна генов в исследовании моторных функций Drosophila melanogaster. VI Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров (ВОГиС) и ассоциированные генетические симпозиумы. Ростов-на-Дону, 15–20 июня 2014 г. Тезисы докладов. С. 44.
Список научных работ
статьи
Rubel M.S., Fedotov S.A., Grizel A.V., Sopova J.V., Malikova O.A., Chernoff Y.O., Rubel A.A. Functional mammalian amyloids and amyloid-like proteins. Life, 2020. Volume 10, № 9, 156. https://doi.org/10.3390/life10090156
IF= 2.99
BIOLOGY 26 из 93 Q2
Kamyshev N.G., Besedina N.G., Bragina J.V., Danilenkova L.V., Fedotov S.A., Goncharova A.A., Kamysheva E.A., Burlakova A.A., Larina O.N. Behavioral changes in Drosophila males after travel to international space station. Acta Astronautica, 2020. Volume 176, P. 567-575 https://doi.org/10.1016/j.actaastro.2020.06.048
IF=2.83
ENGINEERING, AEROSPACE 4 из 31 Q1
Gerasimova E.M., Fedotov S.A., Kachkin D.V., Vashukova E.S., Glotov A.S., Chernoff Y.O. and Rubel A.A. Protein misfolding during pregnancy: new approaches to preeclampsia diagnostics. International Journal of Molecular Sciences, 2019. Volume 20, № 24: 6183. https://doi.org/10.3390/ijms20246183
IF=4.556
BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY 74 из 297 Q1
CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY 48 из 177 Q2
Fedotov S.A., Besedina N.G., Bragina J.V., Danilenkova L.V., Kamysheva E.A., Kamyshev N.G. Overexpression of isoform B of Dgp-1 gene enhances locomotor activity in senescent Drosophila males and under heat stress. Journal of Comparative Physiology A, 2019. Volume 205, № 6. P. 897-910. https://doi.org/10.1007/s00359-019-01378-6 IF=1.516
BEHAVIORAL SCIENCES 44 из 52 Q4
NEUROSCIENCES 238 из 271 Q4
PHYSIOLOGY 67 из 81 Q4
ZOOLOGY 59 из 168 Q2
Fedotov S.A., Bragina J.V., Besedina N.G., Danilenkova L.V., Kamysheva E.A., Kamyshev N.G. Gene CG15630 (fipi) is involved in regulation of the interpulse interval in Drosophila courtship song. Journal of Neurogenetics, 2018. Volume 32, № 1. P 15-26. https://doi.org/10.1080/01677063.2017.1405000 IF=1.536
Goncharova A.A., Bragina Y.V., Fedotov S.A., Kamyshev N.G. Influence of group rearing on sexual behavior of Drosophila melanogaster males. Journal of Evolutionary Biochemistry and Physiology. 2017. 52(6):454-462. https://doi.org/10.1134/S1234567816060045 IF=0.455. Русскоязычная версия: Гончарова А. А., Брагина Ю. В., Федотов С. А., Камышев Н. Г. Влияние группового содержания на половое поведение самцов Drosophila melanogaster. Журнал эволюционной биохимии и физиологии. 2016. Т. 52, № 6. С. 21-28.
Fedotov S.A., Bragina J.V., Besedina N.G., Danilenkova L.V., Kamysheva E.A., Panova A.A., Kamyshev N.G. The effect of neurospecific knockdown of candidate genes for locomotor behavior and sound production in Drosophila melanogaster // Fly. 2014. V. 8, № 3. P 176-87. http://dx.doi.org/10.4161/19336934.2014.983389.
Fedotov S.A., Bragina Yu. V., Besedina N. G., Danilenkova L. V., Kamysheva E. A., Kamyshev N. G. Genetic Determinants of Rhythmic Movements Motor Pattern Generation in Drosophila Melanogaster. Neuroscience and Behavioral Physiology. 2014, Vol. 44, No. 9, P. 995-1001. doi 10.1007/s11055-014-0015-2.
Panova A.A., Bragina J.V., Danilenkova L.V., Besedina N.G., Kamysheva E.A., Fedotov S.A., Kamyshev N.G.. Group rearing leads to long-term changes in locomotor activity of Drosophila males. Open Journal of Animal Sciences. 2013, Vol. 3, No. 4B, P. 31-35. http://dx.doi.org/10.4236/ojas.2013.34A2004.
Федотов С.А., Брагина Ю.В., Беседина Н.Г., Даниленкова Л.В., Камышева Е.А., Камышев Н.Г. Генетические детерминанты генерации моторного паттерна ритмических движений Drosophila melanogaster. Российский физиологический журнал им. И.М. Сеченова. 2013. Т. 99, № 1. С. 120-130.
Федотов С.А., Брагина Ю.В., Беседина Н.Г., Даниленкова Л.В., Камышева Е.А., Камышев Н.Г. Генетическое исследование моторных функций Drosophila melanogaster. Экологическая генетика. 2012. Т. 10, выпуск 1. С. 51-61.
Панова А.А., Федотов С.А., Брагина Ю.В. Влияние социального опыта на локомоторную активность и поведение ухаживания самцов Drosophila melanogaster. Материалы Первой Всероссийской молодежной научной конференции, посвященной 125-летию биологических исследований в Томском государственной университете “Фундаментальные и прикладные аспекты современной биологии”. Труды Томского Государственного Университета. Сер. биологическая. 2010. Т. 275. С. 221-224.
тезисы докладов
Федотов С.А., Беседина Н.Г., Брагина Ю.В., Даниленкова Л.В. Влияние гена fipi на песню ухаживания самцов дрозофилы. Интегративная физиология. Всероссийская конференция с международным участием, посвященная 170-летию со дня рождения И.П. Павлова, Санкт-Петербург, 24–26 сентября 2019 года. Тезисы докладов. С. 252-253.
Fedotov S.A., Besedina N.G., Bragina J.V., Danilenkova L.V., Kamysheva E.A., Kamyshev N. G. Overexpression of isoform B of Dgp-1 gene enhances locomotor activity in senescent Drosophila males and under heat stress. VII International Congress and Associate Symposiums of Vavilov Society of Geneticists and Breeders on the 100th Anniversary of the Department of Genetics of Saint Petersburg State University. Saint Petersburg, Russia June 18-22, 2019. Abstracts P. 520.
Федотов С.А., Брагина Ю.В., Беседина Н.Г., Даниленкова Л.В., Камышева Е.А., Камышев Н.Г. Эффекты нокдауна гена CG15630 (fipi) в обонятельных нейронах на параметры песни ухаживания самцов дрозофилы. Всероссийская конференция «Дрозофила в генетике и медицине», Гатчина, 4-6 октября 2017 года. Тезисы докладов.
Fedotov S.A., Bragina J.V., Besedina N.G., Danilenkova L.V., Kamysheva E.A., Kamyshev N. G. Gene CG15630 (fipi) participates in determination of the interpulse interval in Drosophila courtship song. 16th European Neurobiology of Drosophila conference (Neurofly 2016). Platanias, Chania, Crete, Greece September 2-6, 2016. Abstracts P. 103.
Федотов С.А., Брагина Ю.В., Молотова Н.Г., Даниленкова Л.В., Камышева Е.А., Камышев Н.Г. Исследование роли гена CG15630 в определении параметров звукопродукции у дрозофилы. «Современные проблемы физиологии высшей нервной деятельности, сенсорных и висцеральных систем». Всероссийская конференция с международным участием, посвященная 90-летию со дня основания Института физиологии им. И.П. Павлова РАН, Санкт-Петербург–Колтуши, 8–10 декабря 2015 года. Тезисы докладов. 2015. С. 201-202.
Материалы конкурса
Федотов С.А., Брагина Ю.В., Беседина Н.Г., Даниленкова Л.В., Камышева Е.А., Камышев Н.Г. Генетические детерминанты генерации моторного паттерна ритмических движений Drosophila melanogaster. Материалы всероссийского конкурса научно-исследовательских работ студентов и аспирантов в области биологических наук. Сборник материалов всероссийского конкурса научно-исследовательских работ: в 2 ч. / Под ред. Б.П. Чуракова. Ч. 2. – Ульяновск: УлГУ, 2012. С. 135.
Руководство ВКР
САНКТ-ПЕТЕРБУРГСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ
БИОЛОГИЧЕСКИЙ ФАКУЛЬТЕТ
КАФЕДРА ГЕНЕТИКИ И БИОТЕХНОЛОГИИ
Герасимова Елизавета Михайловна
Разработка новых подходов в диагностике преэклампсии.
Выпускная квалификационная работа бакалавра
по направлению подготовки «Биология»
Работа выполнена в лаборатории Биологии Амилоидов
Заведующий лаборатории
проф. Чернов Юрий Олегович
Участвовал в проектах
В 2018-21 гг. в стипендиальной программе кадровой поддержки исследований, проводимых под руководством ведущих ученых Санкт-Петербурга (Mega_SPbU_2013—6, ID = 34799261, позиция постдока)
В 2016 г. по теме «Изучение роли первого экзона гена CG15630 в детерминации ритма генератора песни у дрозофилы», поддержанного грантом РФФИ № 16-34-00028 (руководитель).
В 2013 г. по теме «Исследования структурно-функциональной организации и молекулярных основ функционирования центральных генераторов моторного паттерна с использованием генетических, иммуногистохимических и нейрофизиологических методов с целью поиска способов реабилитации после повреждений спинного мозга.», поддержанного грантом РФФИ № 13-04-12030.
В 2013 г. по теме «Долговременные пластические изменения поведения в результате социальных взаимодействий между самцами дрозофилы», поддержанного грантом РФФИ № 13-04-02153.
В 2012-2013 гг. в Программе Президиума РАН № 30 «Живая природа: современное состояние и проблемы развития».
В 2012-2013 гг. в Программе Президиума РАН № 7 «Механизмы интеграции молекулярных систем при реализации физиологических функций».
В 2010 – 2012 гг. по теме «Генетические и эпигенетические детерминанты нарушений моторных функций» по госконтракту №П316 в рамках федеральной целевой программы «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» на 2009 – 2013 годы.
В 2010 – 2011 гг. в Программе Президиума РАН «Биологическое разнообразие», подпрограмма «Генофонды и генетическое разнообразие».
В 2010 г. по теме «Генетический подход к изучению функциональной организации центральных генераторов моторного паттерна у дрозофилы», поддержанного грантом РФФИ № 08-04-00997.
С мая 2009 по июнь 2009 г. по теме «Разработка пособия «Экспресс оценка цито-, эмбрио- и генотоксических свойств химических соединений». Систематизация современных методов комплексной экспресс-оценки специфических свойств химических веществ» по госконтракту в рамках федеральной целевой программы «Национальная система химической и биологической безопасности Российской Федерации (2009-2013 годы)».
С ноября 2008 по июнь 2009 г. по теме «Разработка методов диагностики на основе реал-тайм ПЦР вирусных заболеваний птиц: инфекционного бронхита кур, инфекционного ларинготрахеита, болезни Марека, инфекционной бурсальной болезни» в рамках федерально-целевой программы «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2007-2012 годы».
С июня по октябрь 2008 г. по теме “Совершенствование методов диагностики инфекционных болезней” в рамках федеральной целевой программы «Предупреждение и борьба с социально значимыми заболеваниями (2007-2011 годы)», подпрограммы «Вакцинопрофилактика».